Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP74Q9C0B2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CFAP74Q9C0B2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFAP74Q9C0B2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms