Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPL3Q9BY60 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms