Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RNF17Q9BXT8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF17Q9BXT8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms