Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms