Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL6Q9BWW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms