Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFC1Q9BW19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFC1Q9BW19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIFC1Q9BW19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIFC1Q9BW19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFC1Q9BW19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms