Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms