Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB2BQ9BVA1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms