Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms