Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN3Q9BTN0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms