Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
THUMPD2Q9BTF0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms