Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms