Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP44Q9BS26 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms