Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIOK1Q9BRS2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms