Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MXRA8Q9BRK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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