Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms