Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRX2Q99811 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms