Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms