Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHP1Q99653 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms