Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RSF1Q96T23 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
RSF1Q96T23 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RSF1Q96T23 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms