Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2Q96Q42 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ALS2Q96Q42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms