Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPG4P5Q96PW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms