Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3Q96PU9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms