Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA13Q96N96 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms