Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOLD1Q96LR9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOLD1Q96LR9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms