Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD3Q96L08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms