Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC12Q96J65 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms