Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC22AQ96IW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC22AQ96IW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC22AQ96IW7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC22AQ96IW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC22AQ96IW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC22AQ96IW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC22AQ96IW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC22AQ96IW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms