Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHFRQ96EP1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms