Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21BQ96EK2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21BQ96EK2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21BQ96EK2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21BQ96EK2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21BQ96EK2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHF21BQ96EK2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms