Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXPE2Q96DL1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms