Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF501Q96CX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF501Q96CX3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms