Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms