Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
OPTNQ96CV9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms