Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIFAQ96CG3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms