Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE3Q969Y0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms