Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA10Q969M2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA10Q969M2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA10Q969M2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA10Q969M2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms