Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCC1Q92922 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCC1Q92922 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms