Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3CQ92520 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3CQ92520 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms