Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CSRNP3Q8WYN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CSRNP3Q8WYN3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms