Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CASKIN1Q8WXD9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CASKIN1Q8WXD9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms