Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC7Q8WUI4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms