Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSKUQ8WUA8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms