Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPT2Q8TD30 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPT2Q8TD30 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPT2Q8TD30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms