Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms