Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL2Q8NHH9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms