Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF397Q8NF99 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms