Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA4Q8NEY3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms