Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL3Q8ND23 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms