Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG8Q8ND04 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms